Statut : En cours d'exécution
Objectif général : L'objectif de ce projet est de former des chercheurs équatoriens qui mènent des activités de développement et de recherche dans des domaines liés à l'exploration et à l'exploitation de l'information génomique en analyse statistique et informatique permettant l'intégration des différentes analyses d'information dans un seul système informatique. Libre d'utilisation, comme BioConductor sur la plateforme R pour l'analyse et l'interprétation des données génomiques.
Intervenants :
- Lénine Ron Garrido
- Freddy Proano Pérez
- richar rodríguez
Les organisateurs:
- ECU
Domaines de recherche :
- Génomique
- bioinformatique
- La génétique
- Épidémiologie
- protéomique
- Pharmacologie
- Biotechnologie humaine
- animale et végétale
- Systématique et phylogénie
- Microbiologie
Contenu:
- Explication du Syllabus et de la méthodologie
- Introduction à R et Rstudio
- Introduction à la technologie Expression Microarray
- Prétraitement des microréseaux d'expression
- Analyse d'expression différentielle pour les puces à ADN
- GSEA
- Présentation du SNG
- Contrôle de qualité
- Alignement et comptage (Partie I)
- Alignement et comptage (Partie II)
- Expression différentielle pour RNA-Seq
- Restes de la semaine + Sujets : GWAS / QTL
- revoir
- Préparation du manuel BioConductor avec applications génomiques
