Objetivo Geral: Gerar um repositório de observações padronizadas de várias variáveis biológicas com relevância para a modelagem de redes de interação biótica em ecossistemas prioritários no Equador.
Objetivos específicos:
- Projetar e implementar uma estrutura de banco de dados para armazenamento e gerenciamento de grandes volumes de dados padronizados sobre interações bióticas. Para a execução deste objetivo, contamos com a experiência do Dr. Aminael Sánchez Rodríguez, membro da equipe de pesquisa da UTPL, que já participou do projeto e implementação de bancos de dados para repositórios de dados de interação molecular, como COLOMBOS (Engelen, Fu et al. 2011) e MAGIC (Fu, Fierro et al. 2014). Todo esse conhecimento anterior será transferido para o presente projeto. Adicionalmente, e em conjunto com todos os membros das equipas de investigação da UTPL, PUCE-SI e ESPOCH, será desenhado um formato normalizado que permita a incorporação de (meta)dados associados a cada uma das observações de interações bióticas. Conforme citado por Jordano, VáZQUEZ et al. (2009), muitos dos estudos que se referem à amostragem de interações bióticas são incompletos, pois não fornecem dados adicionais (que chamaremos de metadados) além das observações obtidas que permitem julgar a robustez da amostragem. É por isso que o padrão que desenvolveremos neste projeto definirá: a quantidade mínima de informações necessárias para estimar se o esforço amostral que permitiu a coleta de dados é robusto o suficiente (por exemplo, os dados não seriam alterados significativamente se o esforço amostral aumentasse).
- Desenvolver uma aplicação web que permita a entrada padronizada de dados de interação biológica, bem como a sua visualização. Quanto à execução do objetivo 1, iremos basear-nos em experiências anteriores (COLOMBOS e MAGIC) para a conceção de uma aplicação web que permita a comunicação entre os utilizadores finais e a estrutura da base de dados. Este será programado em JavaScript e utilizará as extensões do Cytoscape para visualização dos dados.
Instituições participantes:
UTPL. ESPOCH, PUCE-SI
participantes:
- PhD. Aminael Sanchez.
- MSc. Carlos Carpio.
- MSc. José Andrade.
Orçamento premiado: $25000
Situação do projeto: Processo – Assinatura do Acordo.
