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Projeto de Treinamento no Uso de Ferramentas de Bioinformática e Aplicações Genômicas com BioConductor (em plataforma R)

Estado: em execução

Objetivo Geral: O objetivo deste projeto é capacitar pesquisadores equatorianos que realizam desenvolvimento e pesquisa em áreas relacionadas com a exploração e exploração de informações genômicas em análises estatísticas e computacionais que permitem a integração das diferentes análises de informações em um único sistema de computador. De uso gratuito, como o BioConductor na plataforma R para análise e interpretação de dados genômicos.

Participantes:

  • Lenine Ron Garrido
  • Freddy Proano Perez
  • richar rodriguez

Organizadores:

  • ECU

Áreas de pesquisa:

  • Genômica
  • bioinformática
  • Genética
  • Epidemiologia
  • proteômica
  • Farmacologia
  • Biotecnologia Humana
  • animal e vegetal
  • Sistemática e Filogenia
  • Microbiologia

Conteúdo:

  • Explicação do programa e metodologia
  • Introdução ao R e Rstudio
  • Introdução à Tecnologia Expression Microarray
  • Pré-processamento de Microarray de Expressão
  • Análise de Expressão Diferencial para Microarrays
  • GSEA
  • Introdução ao NGS
  • Controle de qualidade
  • Alinhamento e Contagem (Parte I)
  • Alinhamento e Contagem (Parte II)
  • Expressão diferencial para RNA-Seq
  • Restos da semana + Tópicos: GWAS / QTL
  • análise
  • Elaboração do Manual do BioCondutor com aplicações de Genômica