Resumo executivo: Helicobacter pylori (H. pylori) é uma bactéria Gram-negativa que causa úlcera péptica e câncer gástrico. No Equador, o câncer gástrico está entre os cinco tipos de câncer mais comumente diagnosticados e é uma das principais causas de morte por câncer. A prevalência da infecção por H. pylori varia entre 20 e 80% em diferentes regiões do mundo; no entanto, apenas um pequeno número de indivíduos desenvolve algum quadro clínico.
Fatores genéticos bacterianos e do hospedeiro são determinantes no desenvolvimento de patologias associadas a esta bactéria. H. pylori possui fatores de virulência (citotoxina A, Cac A e exotoxina vacuolizante, VacA) que facilitam a colonização gástrica. A distribuição geográfica de várias cepas de H. pylori estaria associada a diferenças geográficas na distribuição do câncer gástrico. Na Colômbia, por exemplo, a taxa anual de câncer gástrico nos Andes de Nariño é estimada em 30/100.000 enquanto na zona costeira é de 6/100.000, apesar do fato de que a prevalência da infecção por H. pylori é semelhante na Costa e na Serra. Estas diferenças podem dever-se ao facto de as estirpes da Serra terem um genótipo diferente e uma origem filogeográfica europeia, enquanto as estirpes da Costa teriam uma origem europeia e africana. No Equador existem poucos estudos que caracterizaram os genótipos de H. pylori presentes em diferentes regiões geográficas, Costa, Serra e Oriente. Consequentemente, o objetivo geral da presente investigação é comparar os genótipos de diferentes cepas de H. pylori obtidos em amostras de biópsia gástrica de pacientes sintomáticos da Paróquia de Zumbahua, na região andina, com amostras de pacientes de Sushufindi e Lago Agrio, na Amazônia. ; e também estabelecer o cultivo in vitro de H. pylori com a finalidade de realizar estudos de ancestralidade da bactéria. Este estudo tem duas fases: A Fase I corresponde ao recrutamento dos doentes, exame endoscópico, colheita de amostras e estudo patológico, fase esta do estudo já realizada. A Fase II diz respeito à genotipagem de genes de patogenicidade em amostras colhidas na fase I e ao isolamento e cultivo de cepas de H. pylori em novas amostras gástricas para análise de ancestralidade. Para a genotipagem, a presença dos genes de patogenicidade cagA e vacA (s1,s2; m1,m2) será estudada por qPCR, enquanto a ancestralidade será determinada por análise "multi locus sequence tiping". Sete genes housekeeping (atpA, efp, ureI, ppa, mutY, trpC e yphC) serão amplificados usando primers recomendados pelo Instituto Pasteur em culturas primárias de H. pylori. As sequências obtidas serão analisadas no banco de dados (http://pubmlst.org/helicobacter) para determinar os genótipos de cada gene e as sequências-tipo de cada cepa. Posteriormente, uma análise filogenética será realizada para determinar as relações de acasalamento e ancestralidade usando Phyloviz. Os resultados desta pesquisa contribuirão para um melhor manejo dos pacientes infectados pelo H. pylori. Além disso, serão estabelecidas condições para a cultura primária desta bactéria.
Objetivos Gerais: Comparar os genótipos de diferentes cepas de H. pylori obtidos em amostras de biópsia gástrica de pacientes sintomáticos da Paróquia de Zumbahua na região andina com amostras de pacientes de Sushufindi e Lago Agrio na Amazônia equatoriana; e estabelecer o cultivo in vitro de H. pylori com a finalidade de realizar estudos de ancestralidade dessa bactéria.
Objetivos específicos:
- Estabelecer as características sociodemográficas e clínicas dos pacientes participantes do estudo, da Serra Equatoriana (Zumbahua) e da Amazônia (Shushufindi e Lago Agrio).
- Comparar a prevalência e as características macroscópicas e microscópicas das lesões gástricas de biópsias de pacientes voluntários da Serra Equatoriana (Zumbahua) e da Amazônia (Shushufindi e Lago Agrio).
- Determinar a presença dos genes de patogenicidade cagA, vacA (s1, m1, s2, m2) de H. pylori em amostras gástricas de pacientes da Paróquia de Zumbahua na região andina com amostras de pacientes de Sushufindi e Lago Agrio na Amazônia equatoriana.
- Determinar a ancestralidade de culturas de H. pylori de amostras gástricas isoladas de pacientes infectados usando técnicas de genotipagem baseadas em "Multilocus Sequence Typing" (MLST).
Instituições participantes:
UTE, USFQ, ESPOL.
Participantes:
Diretor do projeto Manuel E. Baldeón.
- Manuel E. Baldeon
- Paulo Cárdenas
- Patrícia Manzano
Orçamento premiado: $50000
Situação do projeto: Em andamento.
