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Proyecto de Capacitación en el Uso de Herramientas Bioinformáticas y Aplicaciones Genómicas con BioConductor (en plataforma R)

Estado: En ejecución

Objetivo General: El objetivo del presente proyecto es capacitar a los investigadores ecuatorianos que realizan desarrollo e investigación en las áreas relacionados a la exploración y explotación de información genómica en análisis estadístico y computacional que permita la integración los distintos análisis de información en un solo sistema informático de uso libre como es BioConductor en plataforma R para el análisis e interpretación de datos genómicos.

Participantes:

  • Lenin Ron Garrido
  • Freddy Proaño Pérez
  • Richar Rodríguez

Organizadores:

  • UCE

Áreas de investigación:

  • Genómica
  • Bioinformática
  • Genética
  • Epidemiología
  • Proteómica
  • Farmacología
  • Biotecnología Humana
  • Animal y vegetal
  • Sistemática y Filogenia
  • Microbiología

Contenidos:

  • Explicación del Sílabo y metodología
  • Introduction to R and Rstudio
  • Introduction to Expression Microarray Technology
  • Expression Microarray Preprocessing
  • Differential Expression Analysis for Microarrays
  • GSEA
  • Introduction to NGS
  • Quality Control
  • Alignment and Counting (Part I)
  • Alignment and Counting (Part II)
  • Differential Expression for RNA-Seq
  • Remainders of the week + Topics: GWAS / QTL
  • Evaluation
  • Elaboración de Manual BioConductor con aplicaciones Genómicas